Членами Федерации есть более 70 юридических и физических лиц, общественных, государственных научных организаций, в частности:
- Ассоциация «Украинская ассоциация производителей и переработчиков сои»
- ВОО «Клуб Органического Земледелия»
- ВЭОО «МАМА-86»
- ВОО «Живая планета»
- ОО «Натурпродукт»
- Ведическое органическое сельское хозяйство Махариши
- Национальный аграрный университет
- Национальный ботанический сад им. М.М.Гришка НАН Украины
- Национальный Научный Центр «Институт почвоведения и агрохимии им. О.Н.Соколовского» УААН
- ОАО «Ровнохолод»
- ООО «Агро-Био-Тех»
- ООО «Агрофирма «Гермес»
- ООО «Бизнес Центр Фармация»
- ООО «ЭКОРМИН-ПЛАНЕТА»
- ООО «Микоген-Украина»
- ООО «Микотон-Агликон»
- ООО «Центр Биотехника»
- ООО «Кварк»
- ООО «Полиграф-Сервис»
- ООО «СТВ-Сервис»
- Украинская лаборатория качества и безопасности продукции АПК
- Харьковский государственный университет питания и торговли
- ЧП «Агроэкология»
- ЧП НПГ «Эко-Информ-Сервис»