Для досягнення мети Програми  необхідне виконання наступних завдань:

• cтимулювати розвиток органічного виробництва шляхом надання виробникам органічної продукції фінансової підтримки, а також низки пільг та преференцій;
• при веденні органічного виробництва досягти позитивного впливу на стан ґрунтів, агроландшафти та довкілля в цілому;
• залучити території, де ведеться органічне виробництво до структури національної екомережі, як ефективного механізму збереження ландшафтного біорізноманіття;
• розвивати ринок органічних продуктів та збільшувати, разом із зростаючим ринком, ефективність виробництва та переробки органічної продукції;
• забезпечити захист органічної продукції від забруднення генетично модифікованими організмами;
• сформувати та закріпити довіру споживачів до органічного виробництва та сертифікованої і відповідним чином маркованої органічної продукції;
• за допомогою належним чином сертифікованої органічної продукції сприяти захисту інтересів споживачів;
• розвинути державну спеціалізовану систему сертифікації, надання консультацій, проведення наукових досліджень та навчання для сектору органічної виробництва;
• забезпечити контроль за станом ґрунтів та підвищити відповідальність власників землі та землекористувачів за раціональне використання і охорону земель;
• розширити застосування біологічних методів захисту рослин та тварин, ґрунтозахисних технологій та  проведення дозволених методів хімічної меліорації ґрунтів для підвищення їх родючості.